Strukturalna Biochemia Białek

 0    20 карточки    dominiksura
скачать mp3 Печать играть Проверьте себя
 
Вопрос język polski Ответ język polski
Gdzie znajduje się a-helisa, B-sheet, loops i lewoskrętna a-helisa
начать обучение
Gdzie znajduje się a-helisa, B-sheet, loops i lewoskrętna a-helisa
Resulution in crystalografi
начать обучение
najmniejsza odległość pomiędzy zobserwowanymi płaszczyznami (depends on how large angle it is still possible to record the diffraction pattern maxima)
B- factor
начать обучение
współczynnik temperaturowy, koresponduje ze swobodą ruchów termicznych(oscylacji i drgań) poszczególnych atomów
Problemy w krystalografii
начать обучение
słabej jakości dyfraktogramy, wysoka czystość próbki, trudność w krystalizacji, wysoki koszt dobrej jakości sprzętu, problem faz
Mostki disiarczkowe (disulphide bridge)
начать обучение
tworzą się w warunkach utleniających
Domeny w pojedynczym wielodomenowym białku
начать обучение
zachowują swoją odrębność (retain their original structure in the case of fusion proteins)
Oddziaływania elektrostatyczne
начать обучение
najsilniejsze są w hydrofobicznym centrum, a ekranowane przez rozpuszczalnik
Fałdowanie białek w komórce (cellular enviroment)
начать обучение
Jest trudniejsze ze względu na duże stężenie innych białek (is hampered by molecular crowding, but helped by molecular chaperones)
Pole siłowe (force field)
начать обучение
wszystkie równania i parametry, które pozwalają na odpalenie symulacji
Conformational hyperspace - konformacja białka
начать обучение
kształt zależny od warunków środowiska
Dynamika molekularna nie pozwala na
начать обучение
przewidywanie struktury tylko na podstawie sekwencji (determination of spatial structure of protein)
Zalety i wady NMR
начать обучение
1. Obecność mobilnych fragmentów, 2. Dość mała masa białka
Wiązanie peptydowe w przypadku proliny
начать обучение
Z reguły jest trans, ale potrafi być cis
Najwięcej punktów na Ramachandran plot ma jaki aminokwas
начать обучение
Glicyna
R - factor
начать обучение
Miara dopasowania modelu do danych eksperymentalnych im bliżej 0 tym lepiej
Metoda SAXS (small angle X- ray scattering) zalety
начать обучение
Używana do białek w roztworze, jednak daje tylko ogólny obraz a stężenie białek musi być duże
Serpiny przypadek szczególny
начать обучение
lokalne minimum w conformational landscape może być konformacją aktywną
Oddziaływania van der Waalsa
начать обучение
grają kluczową rolę na małe dystanse
Krystalografia rentgenowska
начать обучение
białko musi krystalizować, mg białka, brak ograniczenia w masie białka
Hinge movement, shear movement, locla foldind/unfolding
начать обучение
ruch zawiasowy(kalmodulina), ślizganie się jednej podjednostki po drugiej

Вы должны войти в свой аккаунт чтобы написать комментарий.