biologia molekularna krótkie wykłady sekcja D

 0    127 карточки    aleksanderwieckowski
скачать mp3 Печать играть Проверьте себя
 
Вопрос język polski Ответ język polski
escherichia coli jaki ma genom
начать обучение
genom prokariotyczny
jak wygląda DNA E. coli
начать обучение
pojedyncza koliście zamknięta cząsteczka DNA
jaka długość ma DNA E. coli
начать обучение
4.6 miliona par zasad
W co jest upakowane DNA E. coli
начать обучение
w nukleoid
jakie stężenie ma nukleoid E. coli
начать обучение
(duże) 30-50 mg*ml-1
z ilu domen składa się nukleoid E. coli
начать обучение
50-100 domen
kształt nukleidu e. coli
начать обучение
domeny przytwierdzone do białka przytwierdzonego do błony komórkowej widok gwiazdy
Chromosom E. coli całościowo jest jaki?
начать обучение
Superhelikalny ∆Lk? Ln(n) =0.06
Co niepozwala rotować się DNA E. coli
начать обучение
Przyłaczenie DNA do białkowo-błonowego rusztowania
Najczęstsze białka wiążące DNA?
начать обучение
HU i H-NS
Białko HU jest?
начать обучение
-małe; zasadowe; z ładunkiem dodatnim; w postaci dimeru
jak białko HU wiąże DNA?
начать обучение
Wiąże owijając wokół własnej cząsteczki
Inna nazwa białka H-NS
начать обучение
wcześniejsza nazwa białko H1
Białko H-NS jest?
начать обучение
monomerem; ma obojętny ładunek;
Białko H-NS preferuje wiązanie się z DNA jakim?
начать обучение
Niespecyficznym przede wszystkim miejsca zagięć helisy DNA
Angielska nazwa H-NS oraz HU (zwyczajowa)
начать обучение
Białko podobne do histonów - Histone-like proteins
na co ma wpływ białka H-NS oraz HU
начать обучение
na kondensacje DNA
Do czego jest potrzebna kondensacja DNA
начать обучение
Jest niezbędna by upakować DNA w nukleotyd i utrzymaniu struktury superhelikalnej chromosomu
co znaczy ∆Lk/Lk(-3)
начать обучение
ze mamy jeden skręt superhelikalny na każde 17 skrętów helisy, w tym połowa skrętów jest wymuszona przez trwałe owiniecie wokół białek HU
inne ważne czynniki w organizowaniu domen DNA
начать обучение
białka, RNA, mRNA, polimeraza RNA
homolog białka HU?
начать обучение
białka IHF (integration host factor- integralny czynnik gospodarza)
Ile razy genom prokariota może być mniejszy od genomu eukariota
начать обучение
Tysiące
DNA eukariota jest upakowany między innymi?
начать обучение
w chromosomach
Ile chromosomów ma człowiek
начать обучение
46
jaką ma długość DNA w chromosomach
начать обучение
około kilku cm liniowej cząsteczki
jak wielkie jest jądro Eukariota
начать обучение
zbliżone do wielkości bakterii
Jak duże stężenie DNA może być
начать обучение
nawet 200 mg*ml(-1)
Co to chromatyna
начать обучение
to kompleks DNA i białek (kompleks nukleoproteinowy) tworzący stopień upakowania DNA
ile procent masy chromatyny to białko
начать обучение
50%
w jakiej fazie najbardziej jest skondensowany chromosom
начать обучение
w metafazie
w jakiej fazie chromosom jest mocno rozproszony
начать обучение
w interfazie
Co to histon
начать обучение
to białka wchodzące w skład chromatyny
na jakie klasy dzielimy histony?
начать обучение
H2A, H2B, H3 i H4 to histony rdzeniowe oraz H1
co to histony rdzeniowe
начать обучение
to histon klasy H2A, H2B, H3 i H4
jakie są histony rdzeniowe w porównaniu do H1
начать обучение
małe białka(mniejsze niż H1), mają masę od 10 do 20 kDa
histony są
начать обучение
mocno dodatnie ładunkiem (ułatwia to silne wiązania z ujemnym DNA), 20 do 30% to zasadowe aminokwasy lizyna oraz arganina
jaką masę mają histony H1
начать обучение
23 kDa
ilość histonów H1 jest mniej więcej połowa ilości innych histonów
начать обучение
ilość histonów H1 jest mniej więcej połowa ilości innych histonów
Nukeaza to?
начать обучение
Enzym hydrolizujący wiązanie fosfodiestrowe w kwasach nukleinowych
Egzonukleazy uwalniają?
начать обучение
pojedyńczę nukleotydy z końców nici kwasów nukleinowych
Endonukleazy rozcinają?
начать обучение
rozcinają wnętrza wiązań fosfodiestrowych
Co powoduje potraktowanie chromatyny nukleazą z mikrokoków?
начать обучение
Powoduje do izolacji fragmentu DNA o różnej wielkości będącą wielokrotnością około 200 pz.
200 pz jest z czym zasocjowane
начать обучение
jest zasocjowane histonowym rdzeniem (okręcone wokół rdzenia) z histonów H2a, H2B, H3 i H4 czyli histonów rdzeniowych
Po pierwszym wycięciu chromatyny nukleazą z mikrokoków i pozostawieniu w dalszym trawieniu nukleazą co się stanie
начать обучение
zostanie struktura zawierająca fragment 146 pz która jest silnie zasocjowana z histonowym oktamerem (histonami rdzeniowymi) wykazuje ona podobieństwo strukturalne niezależnie od miejsca z którego została wycięta
na histonowym rdzeniu oktamerowym mamy ile pz
начать обучение
mamy 146 pz owijające się 1.8 lewoskrętnego zwoju tworząc superhelikalność
Co to nukleosom
начать обучение
nukleosom to rdzeń histonowy (oktamerowy) z nawiniętym DNA w 1.8 skrętu czyli z 146 pz
H1 gdzie się przyczepia?
начать обучение
Przyczepia się do nukleosomu stabilizując miejsce wejścia oraz wyjścia DNA nawijając 20 pz co daje ładnie 166 pz
Czemu odpowiada 166 pz nawiniętych na rdzeń nukleosomu oraz na histon H1
начать обучение
odpowiada 2 pełnym skrętom
Czemu H1 jest większe?
начать обучение
bo ma dodatkowy ogon "C-końcowy" który odpowiada za stabilność DNA pomiędzy nukleosomami
Czy histon H1 może być zamieniony na inny?
начать обучение
W niektórych typach komórek może być zamieniony na swój skrajny wariant na histon H5 który nie ulega transkrypcji.
Co to sznur koralików?
начать обучение
to nukleosony wraz z DNA łacznikowym które jest cienką nicią DNA która uzupełnia do 200 pz powtarzających się podczas doświadczenia z nukleazą
ule wynosi standardowo DNA łącznikowe?
начать обучение
Zwykle około 55pz ale może mieć od kilku do nawet 100 pz
czy histon H1 zwiększa organizacje "koralików"?
начать обучение
Tak wraz z wzrostem stężenia soli aż do powstania włókien średnicy 30nm
Jak nazywa się lewostronna zawinięta helisa wyższego rzędu?
начать обучение
jest to solenoid
na jeden obrót w solenoidzie przypada ile nukleosomów?
начать обучение
6 nukleosomów
Długość DNA w pętli eukariota to?
начать обучение
100 pz w przybliżeniu tyle co u prokariota jednak w chromosomie eukariotycznym mamy znacznie więcej pętli
przez co są końce pętli unieruchomione?
начать обучение
są unieruchomione przez rusztowanie białkowe lub matriks jądrowy (czyli kompleksy białkowe)
Jak wyglądają wymiary wyższych struktur uporządkowania DNA?
начать обучение
tworzą się włókna o średnicy 30 nm oraz z nich pętle o szerokości 300nm
w jakiej fazie chromosom jest najbardziej skondensowany?
начать обучение
w mitozie
przed czym chroni chromosom duże skondensowanie?
начать обучение
Przed rozerwaniem DNA
Przez co są rozdzielane chromosomy?
начать обучение
Przez wrzeciono mitotyczne.
Co mamy na końcach chromosomów oraz DNA
начать обучение
Telomery
Centromer to
начать обучение
Ograniczony rejon gdzie łącza się dwie chromatydy siostrzane tworząc chromosom
co to kinetochor
начать обучение
kompleks białkowy przyłączający się do mikrotubul wrzeciona mitotycznego
Co rozdzielają mikrotubule
начать обучение
Rozdzielają chromatydy podczas anafazy
długość centromeru u drożdży?
начать обучение
88pz bogatych w AT
Centromer Eukariota ograniczony jest
начать обучение
satelitarnym DNA (sekwencjami powtarzającymi się)
Co zawiera telomer?
начать обучение
zawiera setki kopi sekfencji (5-TTAGGG-3 u człowieka)
Co syntetyzuje telomeraza
начать обучение
sekfencje (5-TTAGGG-3)
co to telomeraza?
начать обучение
jest to rodzaj rybonukleoproteiny
Co zabezpiecza telomer
начать обучение
końcówkę chromosomu
Jak uchronić telomer przed skracaniem?
начать обучение
należy syntetyzować niezależnie telomer
co zachodzi podczas interfazy
начать обучение
transkrypcja genów na chromosomach oraz replikacja DNA
jak długo trwa faza S (interfaza)
начать обучение
większość czasu
jaką strukturę przyjmują chromosomy podczas interfazy?
начать обучение
przyjmują strukturę bardziej rozproszoną nie da się ich rozróżnić
co to heterohromatyna
начать обучение
jest to część chromatyny w interfazie jaka dalej jest mocno skondensowana jednak nie aż tak silnie jak w metafazie
z czego składa się heterochromatyna
начать обучение
z satelitarnego DNA jest transkrypcyjnie nieaktywna przykładem jest chromosom X u samic ssaków.
gdzie widzimy heterochromatynę w jądrze pod mikroskopem
начать обучение
widzimy ją na obrzeżach jądra jako ciemne prążki
Co to Euchromatyna
начать обучение
pozostała część chromatyny inna niż heterochromatyna
Co się dzieje z Euchromatyną aktywną transkrypcyjnie
начать обучение
może być bardziej rozproszona już rozwinięta z pętli 30nm aż do sznura koralików czy nawet odwinięta z nukleosomów by łatwo przyłączać czynniki transkrypcyjne
Jaka cześć euchromatyny jest aktywna transkrypcyjnie?
начать обучение
10%
gdzie znajduje się gen?
начать обучение
w miejscach aktywnych transkrypcyjnie
jak mapuje się miejsca aktywne transkrypcyjnie?
начать обучение
szuka się miejsc z nadwrazliwościa na DNazę I czyli deoksyrybonukleazę I
Co robi DNaza I
начать обучение
rozcina DNA
sygnał do odpowiedniego poziomu upakowania chromosomu w miejscach genów ulegających ekspresji jest?
начать обучение
metylacja C-5 cytozyny występująca w sekfencji 5-CG-3
powszechnie nazwa metylacji C - 5 cytozyny?
начать обучение
metylacja CpG
gdzie znajdują się niezmetylowane wyspy CpG?
начать обучение
W obrębie genów aktywnych transkrypcyjnie
Jak długie są niezmetylowane wyspy CpG?
начать обучение
2000 pz
co się dzieje z zmetylowaną sekwencją CpG?
начать обучение
szybko mutuje do TpG z powodu spontanicznej deaminacji 5'-metylocytozyny do tyminy
przykład występowania histonu H5?
начать обучение
w krwinkach czerwonych ptaków
aktywnej transkrypcji chromatyny towazyszy
начать обучение
acetylacja reszty lizyny w N-końcowych domenach
co towarzyszy kondensacji chromosomów?
начать обучение
fosforylacja histonu H1
unikatowe sekwencje DNA
начать обучение
hybrydyzują wolniej, są często aktywne transkrypcyjnie
tandemowe zespoły genów
начать обучение
to takie jakie maja sekwencje transkrypcyjną wielokrotnie powtórzona. np geny transkrybujące RNA czy DNA
sekwencje SINES
начать обучение
krótkie elementy rozproszone od kilkuset pz
sekwencje LINES
начать обучение
od tysiąca do 5 tysięcy pz (długie elementy rozproszone
najpopularniejsze LINES u człowieka
начать обучение
sekfencja Alu
długość sekwencji Alu?
начать обучение
300pz
jak często występuje Alu?
начать обучение
300000 a 500000 razy się powtarza z 80% 90% procentową powtarzalnością
długość DNA satelitarnego?
начать обучение
od 2 do 20-30 pz
podział DNA sateliarnego?
начать обучение
minisatelity oraz mikrosatelity
minisatelity
начать обучение
tandemowe powtórzenia o zmiennej liczbie powtórzeń VNTR
mikrosatelity
начать обучение
proste powtórzenia tandemowe STR
gdzie znajdziemy minisatelity VNRT
начать обучение
najczęściej w pobliżu końca chromosomów
Gdzie znajdziemy mikrosatelity? (SRT)
начать обучение
wzdłuż całego chromosomu
do czego stosujemy minisatelity
начать обучение
do zbadania odcisku DNA np w celu sprawdzeniu pokrewieństwa
sekwencja polimorficzna
начать обучение
to sekwencja inna niż na chromosomie homologicznym lub jeśli występuje inna sekwencja niż standardowa u danego gatunku
SNP
начать обучение
polimorfizm pojedynczych nukleotydów
SSLP
начать обучение
polimorfizm długości pojedynczej sekwencji
RFLP
начать обучение
polimorfizm długości fragmentów restrykcyjnych
dogmat biologii molekularnej
начать обучение
Z DNA powstaje RNA które tworzy białka
polimeraza RNA co robi
начать обучение
transkrybuje gen poczynając od promotora a kończąc na terminatorowej sekwencji
RNA kodujący kilka białek to
начать обучение
RNA polistronicowy
translacja RNA na białko odbywa się w?
начать обучение
rybosomach
miejsce RNA gdzie koduje kilka białek nazywane jest?
начать обучение
Operonem
RNA jakie jest tłumaczone w Rybosomach to
начать обучение
mRNA (messege RNA)
kodon startu to
начать обучение
kodon inicjatorowy zwykle AUG
tRNA mają funkcje?
начать обучение
transportują aminokwasy do rybosomów w celu tworzenia białek (tRNA - transport RNA)
jak wygląda ekspresja genów u prokariota
начать обучение
polimeraza RNA transkrybuje gen następnie przez transkrypcje mRNA i przenoszony do rybosomu tam udział tRNA które donosi aminokwasy. Zwykle sekfencja kodonu inicjatora to AUG przy końcu 5' a terminator jest na końcu 3'
pre-mRNA
начать обучение
RNA jakie jest transkrybowane w jądrze komórkowym i syntetyzowane przez polimeraze II
pre - mRNA jest transkrybowane przez którą po
начать обучение
polimeraze II
zwykle u eukariota jest kodowane tylko jedno białko
начать обучение
miejsca transkrypcyjne są monostronicowe
kapowanie
начать обучение
czyli dodanie do pre-mRNA ogonu poli (A) na końcu 3' co zwiększa stabilność
introny
начать обучение
sekwencję przerywające kodowanie białka
splicing
начать обучение
usuwanie intronów z pre-mRNA i powstanie eksonów
snRNA
начать обучение
małe jąderkowe RNA
snRNA powstaje?
начать обучение
w wyniku splicingu

Вы должны войти в свой аккаунт чтобы написать комментарий.